在利用炭棒菌定巢位时，必须认真负责、耐心细致地进行检查。否则，由于堤坝上某些因素的干扰，很容易将生长出地面的炭棒菌破坏掉，从而找不到巢位。在无干扰的情况下，炭棒菌可在地面上持续生长2~3个月或更长时间。

　　据报道，白蚁巢内高浓度的二氧化碳抑制炭棒菌的生长发育，当白蚁巢衰亡或被灭杀后，巢内的二氧化碳浓度逐渐下降，于是竞争性很强的炭棒菌就很快生长发育起来。在解剖灭杀后的蚁巢时，也证实了这种理论，即地面上虽然有炭棒菌生长，但是巢内的白蚁还没有完全死亡，可是菌圃上的小白球菌基本上消失了，只是个别菌圃的底面上还有零星小白球菌存在，这说明时间稍长全巢白蚁就会死亡。