微生物杀虫剂对人畜安全无毒，不污染环境，杀虫作用具有一定的特异性和选择性，不会致死天敌和非目标昆虫；易和其他生物手段结合综合防治害虫，维持生态平衡。由于杀虫活性蛋白的多样性，昆虫产生抗性较缓慢，可以通过基因工程技术途径筛选或构建优良性能的菌株来满足生产与应用所需。

　　基因工程技术的应用为农业微生物遗传改良与各类微生物杀虫剂的开发开辟了新的途径，可以将某种控制杀虫活性基因转移到安全易培养的细菌即遗传工程菌中，使工厂化生产成为可能。目前的研究已经显示了这项技术发展的巨大潜力。应用基因工程技术生产和修饰改造这些生物杀虫剂，为微生物制剂用于虫害治理开创了新局面。

　　杀虫微生物中研究最多、用量最大的是苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis，Bt）。Bt杀虫作用的主要机制是在其生长过程中产生不同类型的杀虫晶体蛋白（ICP）。自1981年Schnepf分离了第一个cry基因以来，迄今全世界从Bt中发现并正式命名的ICP基因已有42大类，总数超过250种。在国家“863”计划的支持下，近年我国Bt分子生物学的研究发展迅速。1997年以来已经克隆了28种 ICP基因，占同期国际新记载Bt基因总数的1/3。除ICP 以外，Bt 与蜡样芽孢杆菌营养生长阶段产生的另一种杀虫蛋白 VIP也引起了广泛注意，有的vip 基因对一些重要农业害虫更显特异性，因而具有很大的开发应用潜力。为了进一步提高Bt的杀虫效果，如延长持效期、扩大杀虫谱等，可以通过杀虫基因的修饰、改造、转移等基因工程手段构建新型的工程菌。美国Mycogen公司将Bt毒蛋白基因转入定殖在植物根部的荧光假单胞菌中，使杀虫作用可延长到两周以上，使小菜蛾的杀虫效果与化学农药相当。这种工程杀虫菌剂无污染环境的副作用，1991年登记注册，商品名为MVP，成为一种新型的微生物杀虫剂，用于蔬菜害虫防治。Andrews（1992）首次将Bt基因构建于内生细菌木质棍状杆菌犬齿亚种中进行玉米螟虫生物防治并取得成功。目前在国外已有Conder、MVP等十余种Bt工程菌制剂投入了商业应用。我国也开发出多种高效Bt 和荧光假单胞菌的组合基因工程菌剂，其中WG001已于2000年通过安全性审批，允许生产和应用。在国家“863”计划的支持下，Bt基因改良研究也取得了重要进展，已克隆出具有自主知识产权的基因几十个，有两个基因工程产品已进入中试阶段。

　　利用基因工程技术，任何生物体都可以获得并表达cry基因并进行相关的修饰。目前，cry基因已经被转移到不同的细菌和植物中并高效表达，例如，cry基因被转移到在水生环境中茂盛生长的蓝细菌中，可以使蚊子聚集的环境保持高水平的毒素。这种类型的基因转移为作物保护和致病昆虫的抑制提供了新思路。对苏云金芽孢杆菌进行遗传改良，可达到扩大杀虫谱和提高杀虫毒力的目的，并在此基础上分别构建了对棉铃虫、小菜蛾、甜菜夜蛾、斜纹夜蛾等害虫高效的工程菌，已进入田间试验阶段。另外，还有一些芽孢杆菌也可以用作农业杀虫剂，如球形芽孢杆菌、金龟子芽孢杆菌等。人们发现，伴胞晶体易与芽孢分离暴露在环境中，使其活性降低。为解决这一问题，已将携带8-内毒素的质粒运用基因工程技术转移到革兰氏阴性菌荧光假单胞菌中。田间试验证明，此工程菌株比苏云金芽孢杆菌制剂防治害虫更有效。