真菌是进行白蚁防治的一种很有前途的化学药剂替代物。目前，已发现15种真菌对不同种白蚁表现出显著毒力，而大多数生物活性测定都集中在球孢白僵菌和金龟子绿僵菌这2种病原真菌。研究发现，金龟子绿僵菌对狭颈动白蚁和澳校象白蚁具有致病性。

　　关于球孢白僵菌和金龟子绿僵菌对土栖白蚁的影响也有大量的研究。研究结果表明，病原真菌的品系、浓度以及侵染方式均影响其对不同白蚁种类的侵染效果。球孢白僵菌和金龟子绿僵菌对台湾乳白蚁、桑顿散白蚁和曲颚乳白蚁均有很高的致病性，且与孢子接触时间越长，致病效果越好。白蚁带菌后通过个体间的相互清洁、交哺和同类相残等行为,使病菌在种群内传播、感染。为了使球孢白僵菌和金龟子绿僵菌能在野外有效地控制白蚁，很多学者用这2种病原真菌的分生孢子直接处理台湾乳白蚁蚁道和回巢的白蚁个体。研究结果表明，此方法在室内能很好地控制白蚁，但不能在巢内传播，野外的效果不理想。到目前为止，将大量孢子直接注入蚁巢的野外试验已取得很好的效果。将球孢白僵菌或金龟子绿僵菌制成白蚁饵剂，让白蚁取食并将病原菌带回巢内，这可能是应用病原真菌防治土栖白蚁的最佳途径。但是，金龟子绿僵菌的分生孢子和毒素对白蚁具有明显的忌避效果。很多学者尝试克服这种排斥性问题，以多传输潜在的病原体，但没有适用的配方。

　　尽管昆虫病原真菌长期以来被认为是白蚁生物防治的最佳候选者，但Culliney和Grace指出，由于缺乏良好的野外应用功效，以致无法证明它们具有生物控制应用的潜力，再加上白蚁能避免与霉菌杀虫剂处理的领域接触，所以真菌病原体在地下巢体种群间的扩散应用仍然是个问题。Grace和Zoberi认为，健康的白蚁可能是病原菌分生孢子的有效载体，但白蚁被杀死后，分生孢子的转移效率就变得很低，甚至为零，这是因为白蚁会很快地将感染病菌的同伴尸体迅速肢解或掩理。白蚁的社会行为和生理防御会减少真菌病原体在巢体间的传播。